sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-AQ-A54N	1	61735	2548580	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	2549365	23490328	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	23492782	23715246	3	1
TCGA-AQ-A54N	1	23716628	24249303	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	24256615	25947120	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	25954417	26266697	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	26267260	26501044	3	1
TCGA-AQ-A54N	1	26504756	37933351	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	37938341	40196791	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	40198587	66378506	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	66382744	66916642	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	66920432	67905208	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	67906072	68141361	3	2
TCGA-AQ-A54N	1	68141725	121482979	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	144007049	149732625	4	1
TCGA-AQ-A54N	1	149732729	150738373	10	1
TCGA-AQ-A54N	1	150738699	157041694	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	157042627	157366676	7	1
TCGA-AQ-A54N	1	157366978	182722743	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	182728887	183295930	5	2
TCGA-AQ-A54N	1	183298150	189570994	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	189572371	214637808	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	214638436	214882983	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	214883583	222658204	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	222692620	230594837	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	230596996	238755381	7	1
TCGA-AQ-A54N	1	238755796	246955978	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	246956928	247944276	4	4
TCGA-AQ-A54N	1	247944368	249224388	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	12784	9624553	4	1
TCGA-AQ-A54N	2	9624794	10140651	5	2
TCGA-AQ-A54N	2	10140995	11443448	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	11443570	11740177	5	2
TCGA-AQ-A54N	2	11741157	24994445	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	24994570	25502943	7	1
TCGA-AQ-A54N	2	25507637	37272847	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	37276945	38523542	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	38527508	38955866	7	1
TCGA-AQ-A54N	2	38956947	46983241	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	46985925	47182764	2	2
TCGA-AQ-A54N	2	47183706	96834049	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	96836512	98637504	4	1
TCGA-AQ-A54N	2	98638513	151339540	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	151344984	152631903	2	2
TCGA-AQ-A54N	2	152632681	185710585	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	185719174	186774055	3	1
TCGA-AQ-A54N	2	186777618	243089456	2	1
TCGA-AQ-A54N	3	60345	12847499	2	0
TCGA-AQ-A54N	3	12847977	12960721	4	0
TCGA-AQ-A54N	3	12962243	90485962	2	0
TCGA-AQ-A54N	3	90502862	98103424	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	98108370	100112154	5	2
TCGA-AQ-A54N	3	100122624	122605107	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	122605544	123913550	4	2
TCGA-AQ-A54N	3	123914191	141706144	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	141710038	142106759	5	2
TCGA-AQ-A54N	3	142109130	150309653	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	150315244	150889879	3	2
TCGA-AQ-A54N	3	150892277	191786881	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	191787312	192994285	5	2
TCGA-AQ-A54N	3	192998281	197896118	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	12281	1111594	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	1112519	1412012	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	1416419	85843721	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	85847404	88126626	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	88129105	92431609	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	92432211	93649519	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	93650619	114629837	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	114631347	115572473	3	2
TCGA-AQ-A54N	4	115575979	117895192	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	117897658	118645797	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	118646311	140896353	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	140896553	141291277	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	141298609	153708299	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	153716517	153972354	3	1
TCGA-AQ-A54N	4	153972810	154244953	4	2
TCGA-AQ-A54N	4	154248906	155079387	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	155079767	173566021	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	173566764	174409728	3	1
TCGA-AQ-A54N	4	174411467	182202499	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	182202721	182784721	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	182789614	191027923	2	1
TCGA-AQ-A54N	5	15532	3220349	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	3221409	4912287	5	2
TCGA-AQ-A54N	5	4912310	14526508	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	14526855	16980192	3	2
TCGA-AQ-A54N	5	16991911	28309954	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	28316657	28572856	5	2
TCGA-AQ-A54N	5	28575115	43254058	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	43256445	43609087	5	2
TCGA-AQ-A54N	5	43609272	49432831	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	49441958	50168514	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	50168597	50244106	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	50248171	115234092	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	115238716	115371082	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	115371271	136677353	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	136684103	137438834	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	137441767	138186389	6	0
TCGA-AQ-A54N	5	138188711	169974484	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	169978258	170305603	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	170306084	180790320	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	149661	4683018	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	4684837	5340175	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	5360933	18187916	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	18187927	18324635	5	0
TCGA-AQ-A54N	6	18324720	42278544	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	42280290	45847146	3	0
TCGA-AQ-A54N	6	45847619	57215494	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	57226182	58152147	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	58152441	62960640	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	62961519	64123577	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	64125485	71352929	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	71361754	71683014	15	3
TCGA-AQ-A54N	6	71683151	71821519	7	2
TCGA-AQ-A54N	6	71825163	73751956	2	2
TCGA-AQ-A54N	6	73752010	73998001	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	74000355	75231044	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	75235159	76252896	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	76270279	76448619	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	76454386	118593308	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	118599800	118645960	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	118646016	125392315	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	125396409	125671833	5	0
TCGA-AQ-A54N	6	125671951	154511498	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	154511534	155940980	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	155942814	161318210	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	161320931	162297603	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	162298351	171051005	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	43259	47098317	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	47098602	47098602	4	0
TCGA-AQ-A54N	7	47099832	47108237	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	47112471	48198036	4	0
TCGA-AQ-A54N	7	48199099	58017244	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	58019970	94763301	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	94764470	97086734	3	1
TCGA-AQ-A54N	7	97087089	119003685	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	119006862	120535338	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	120540488	150363700	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	150367757	150800739	2	2
TCGA-AQ-A54N	7	150801817	154262982	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	154268069	154836444	4	1
TCGA-AQ-A54N	7	154839857	159127004	2	1
TCGA-AQ-A54N	8	31254	3450663	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	3451057	3882212	2	1
TCGA-AQ-A54N	8	3882332	4040458	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	4040963	4117636	2	0
TCGA-AQ-A54N	8	4121520	22076333	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	22079305	22416412	4	2
TCGA-AQ-A54N	8	22416808	34124135	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	34124808	34860582	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	34861624	35190518	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	35196417	35729585	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	35732519	61177209	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	61177662	62344793	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	62345391	91222654	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	91223560	92302721	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	92307788	95090644	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	95090785	95852649	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	95857447	100627033	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	100630636	100685783	7	0
TCGA-AQ-A54N	8	100696695	102006633	5	3
TCGA-AQ-A54N	8	102007701	116858016	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	116860207	117277564	5	3
TCGA-AQ-A54N	8	117278736	119151759	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	119152919	119335297	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	119336571	119368516	4	0
TCGA-AQ-A54N	8	119368718	119376989	5	0
TCGA-AQ-A54N	8	119379240	124161980	2	0
TCGA-AQ-A54N	8	124162627	124934256	3	0
TCGA-AQ-A54N	8	124934336	128229705	2	0
TCGA-AQ-A54N	8	128231945	128458151	3	0
TCGA-AQ-A54N	8	128458309	128706719	7	0
TCGA-AQ-A54N	8	128706771	128866468	10	0
TCGA-AQ-A54N	8	128873549	146298155	2	0
TCGA-AQ-A54N	9	46587	34546365	4	0
TCGA-AQ-A54N	9	34550295	115378294	2	0
TCGA-AQ-A54N	9	115383253	115417891	4	0
TCGA-AQ-A54N	9	115418721	132209503	2	0
TCGA-AQ-A54N	9	132218885	132832569	3	0
TCGA-AQ-A54N	9	132835874	141091394	2	0
TCGA-AQ-A54N	10	72759	6325236	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	6327132	8256030	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	8257388	21450646	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	21453797	21831690	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	21832712	79228709	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	79230101	81073515	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	81074381	81809042	6	2
TCGA-AQ-A54N	10	81810488	87857840	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	87857868	90160919	3	2
TCGA-AQ-A54N	10	90163951	90554757	5	3
TCGA-AQ-A54N	10	90555059	93797788	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	93798612	94116677	5	3
TCGA-AQ-A54N	10	94116891	95027617	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	95032057	95253280	4	3
TCGA-AQ-A54N	10	95258040	105364733	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	105365181	106843519	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	106846234	107923401	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	107924369	108410342	5	2
TCGA-AQ-A54N	10	108410585	132768326	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	132771370	133942629	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	133942779	135506704	2	2
TCGA-AQ-A54N	11	198572	515931	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	516520	1007226	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	1007257	12177793	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	12182460	12318483	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	12318739	22316829	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	22316909	23004983	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	23005746	48989655	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	48991476	61487690	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	61494804	65088391	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	65088498	65531653	5	2
TCGA-AQ-A54N	11	65537156	66991617	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	66994278	70924933	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	70927425	71172258	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	71177622	77171649	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	77171665	77461942	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	77466334	78026516	3	2
TCGA-AQ-A54N	11	78029707	78507790	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	78509347	82501382	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	82502661	91250201	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	91251207	94766944	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	94767347	94894963	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	94898811	113974926	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	113975446	114162776	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	114163771	129177172	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	129178667	129795829	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	129799824	134944770	1	1
TCGA-AQ-A54N	12	150442	421408	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	423814	1836365	4	1
TCGA-AQ-A54N	12	1840733	3028009	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	3030726	3299077	2	2
TCGA-AQ-A54N	12	3301706	11090869	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	11091551	11673146	4	1
TCGA-AQ-A54N	12	11673268	12274935	17	1
TCGA-AQ-A54N	12	12282887	12453808	10	1
TCGA-AQ-A54N	12	12454262	13053305	4	1
TCGA-AQ-A54N	12	13053490	24776644	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	24779025	26371637	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	26372478	53950568	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	53951246	55536669	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	55539159	79474448	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	79474795	79951566	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	79953757	121578450	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	121578473	122234191	2	2
TCGA-AQ-A54N	12	122247282	122786515	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	122789573	128125202	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	128125258	129431957	2	2
TCGA-AQ-A54N	12	129432693	133778189	2	1
TCGA-AQ-A54N	13	19026949	24916077	2	0
TCGA-AQ-A54N	13	24921717	25067575	4	0
TCGA-AQ-A54N	13	25070280	38075965	2	0
TCGA-AQ-A54N	13	38076267	38115110	0	0
TCGA-AQ-A54N	13	38125187	50206878	2	0
TCGA-AQ-A54N	13	50223520	50482190	4	0
TCGA-AQ-A54N	13	50491963	115108397	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	19002124	43739294	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	43744706	44622317	4	0
TCGA-AQ-A54N	14	44629663	55710748	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	55711674	56112740	4	0
TCGA-AQ-A54N	14	56114866	68724173	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	68725568	69009739	3	0
TCGA-AQ-A54N	14	69011043	69392881	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	69393028	69798819	4	0
TCGA-AQ-A54N	14	69801109	107285437	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	20016328	48551454	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	48552283	48914926	4	0
TCGA-AQ-A54N	15	48915550	64017323	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	64017448	64666906	3	0
TCGA-AQ-A54N	15	64671336	72314313	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	72322222	72585579	5	0
TCGA-AQ-A54N	15	72593954	77469019	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	77469643	77888844	6	0
TCGA-AQ-A54N	15	77888924	83872796	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	83874040	84058592	4	0
TCGA-AQ-A54N	15	84060590	84795609	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	84796160	86518259	3	0
TCGA-AQ-A54N	15	86519240	102469040	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	60777	349293	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	351673	3420814	3	0
TCGA-AQ-A54N	16	3425325	6754930	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	6755414	7613488	4	0
TCGA-AQ-A54N	16	7614082	9250172	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	9256437	9685760	4	0
TCGA-AQ-A54N	16	9688055	23869706	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	23872482	24092364	4	0
TCGA-AQ-A54N	16	24098527	70855202	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	70855479	71202797	3	1
TCGA-AQ-A54N	16	71205194	90287535	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	526	8721285	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	8721608	27026923	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	27027444	27962228	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	27962393	30261760	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	30266928	31024637	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	31029611	70976111	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	70980287	72635906	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	72636068	81049726	2	0
TCGA-AQ-A54N	18	48133	78015057	2	1
TCGA-AQ-A54N	19	90910	6835668	2	0
TCGA-AQ-A54N	19	6849906	7920930	4	0
TCGA-AQ-A54N	19	7925985	14964854	2	0
TCGA-AQ-A54N	19	14965792	16973979	5	0
TCGA-AQ-A54N	19	16978008	21436825	2	0
TCGA-AQ-A54N	19	21437156	22075928	2	2
TCGA-AQ-A54N	19	22076340	22827827	5	2
TCGA-AQ-A54N	19	22832585	38688871	2	2
TCGA-AQ-A54N	19	38705142	39322575	4	2
TCGA-AQ-A54N	19	39323037	59097854	2	2
TCGA-AQ-A54N	20	61305	7547618	1	1
TCGA-AQ-A54N	20	7548252	8062057	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	8062354	19523164	1	0
TCGA-AQ-A54N	20	19523316	19772734	2	0
TCGA-AQ-A54N	20	19775218	22259990	1	0
TCGA-AQ-A54N	20	22266113	22735915	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	22738054	26305579	1	0
TCGA-AQ-A54N	20	29420352	35062664	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	35063291	35684650	2	2
TCGA-AQ-A54N	20	35696559	39415170	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	39415322	41066671	2	2
TCGA-AQ-A54N	20	41067504	43731170	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	43733015	44107935	5	1
TCGA-AQ-A54N	20	44110551	48483221	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	48483623	49970103	4	1
TCGA-AQ-A54N	20	49972268	58312294	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	58313077	58678664	3	1
TCGA-AQ-A54N	20	58681338	59188729	4	2
TCGA-AQ-A54N	20	59189938	59347548	3	1
TCGA-AQ-A54N	20	59347665	61838890	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	61842260	62956153	3	2
TCGA-AQ-A54N	21	10736871	45252938	2	1
TCGA-AQ-A54N	21	45257112	45690759	2	2
TCGA-AQ-A54N	21	45691339	48096957	2	1
TCGA-AQ-A54N	22	16052528	18896301	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	18904838	19639383	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	19640708	20754239	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	20754506	22018219	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	22024315	22534772	5	0
TCGA-AQ-A54N	22	22534809	30849080	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	30851955	30930175	4	0
TCGA-AQ-A54N	22	30940372	36247023	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	36248363	36640627	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	36644074	36968823	7	0
TCGA-AQ-A54N	22	36971044	37638617	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	37642925	37707962	7	0
TCGA-AQ-A54N	22	37710295	39181596	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	39181805	51234455	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	168477	16480599	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	16480658	17134106	3	1
TCGA-AQ-A54N	X	17134119	45079412	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	45086818	50297470	3	1
TCGA-AQ-A54N	X	50298595	56202494	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	56218339	57444702	6	1
TCGA-AQ-A54N	X	57451600	66314876	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	66315445	68928742	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	68932212	70795518	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	70816449	70853525	6	0
TCGA-AQ-A54N	X	70854563	71906052	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	71906807	107611024	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	107611148	108363541	4	0
TCGA-AQ-A54N	X	108364209	108688491	12	0
TCGA-AQ-A54N	X	108691875	110539208	4	0
TCGA-AQ-A54N	X	110540503	129072118	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	129076847	129738417	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	129740885	134256044	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	134296638	137652095	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	137652251	155233846	2	0
